Para el estudio de las interacción entre las proteínas y el ADN se utiliza la secuenciación de la cromatina inmunoprecipitada (ChIP-Seq). Esta metodología permite estudiar las variaciones en la regulación de todo un genoma en diferentes situaciones, el estudio concreto de los genes implicados en diferentes enfermedades o cambios en rutas de señalización. En Seqplexing ofrecemos el análisis de los datos procedentes de la técnica ChIP-Seq para poder estudiar a gran escala dentro del genoma las regiones de unión a proteínas (factores de transcripción, histonas, etc.).​