El estudio de RNA total de procariotas o eucariotas permite conocer el conjunto de RNAs presentes en una muestra, detectando sus variantes y su cuantificación.
eliminación de rRNA con el objetivo de obtener mayor información en la secuenciación
Se ofrece mayor número de lecturas por muestra en comparación con la secuenciación normal
Servicio disponible para muestras de exosomas o microvesículas, biofluidos, células, tejidos, muestras en FFPE, etc.
mRNA sequencing
Secuenciación de mRNA completo: El estudio de mRNA completo en eucariotas permite conocer los niveles de mRNA de los diferentes genes y sus mRNAs alternativos.
Servicio disponible para muestras de exomas o microvesículas, biofluidos, células, tejidos, etc.
RNA total o enriquecido mediante poliT
Requiere una alta integridad del RNA
Secuenciación de 3’ mRNA: El estudio de la región 3’ de RNA mensajero permite la cuantificación de los niveles de RNA de forma muy económica.
Sólo se secuencia una parte del gen (no permite analizar la secuencia completa del mRNA de un gen)
Permite cuantificar la cantidad de mRNA procedente de un gen determinado en conjunto o para los diferentes sitios de poliadenilación de un mRNA
Bajo requerimiento en el número de lecturas
Servicio disponible para muestras de exomas o microvesículas, biofluidos, células, tejidos, FFPE, etc.
sncRNA-miRNA sequencing
Los RNAs pequeños (miRNA, piRNA, siRNA, snoRNA, tsRNA y srRNA) son RNAs no codificantes que intervienen tanto en el silenciamiento génico como en la regulación del genoma. Su estudio permite conocer la secuencia, así como su cuantificación (profiling).
Servicio disponible para muestras de plasma, biofluidos, exosomas, medios de cultivo, células, tejidos etc.
RNA synthesis analysis
Distinguir el RNA recién sintetizado (naciente) del RNA total, así como conocer directamente las tasas de síntesis y degradación de RNA es útil en estudios sobre tratamientos farmacológicos, moduladores de proteínas, vías de señalización, etc. La incorporación de nucleótidos marcados mientras se sintetiza el nuevo RNA permite conocer la cinética de la síntesis y el recambio de RNA, medir la expresión y estabilidad del RNA naciente, mejorar la resolución de la expresión diferencial, identificar objetivos transcripcionales primarios y secundarios o identificar qué genes son los que están generando nuevos RNAs. Este servicio es aplicable a:
Estudios en células en cultivo en unas condiciones determinadas y sin requerir aislamiento bioquímico (estudios de pulso y caza para RNA)
Estudios de secuenciación de RNA total, mRNA, 3’mRNAs