El gen del rRNA 16S es un locus característico de procariotas (bacterias y arqueas) que codifica para la subunidad pequeña ribosomal. Está formado por 1500 pb donde se encuentran regiones hipervariables (V1-V9) intercaladas entre regiones conservadas. El estudio de las regiones más variables (V3-V4) es una herramienta molecular potente cuya finalidad es diferenciar entre taxones y establecer una filogenia dentro de una comunidad microbiana heterogénea. Es una técnica sencilla que permite el análisis de toda la comunidad microbiana sin necesidad de cultivo.

El rRNA 18S es un componente de la subunidad pequeña de los ribosomas de eucariotas. Las ITS (ITS1 e ITS2) son regiones espaciadoras internas adyacentes al gen de rRNA 18S. Secuenciar tanto el gen de rRNA 18S como ITS1 e ITS2 permite una cobertura completa de la región génica y permite clasificar organismos eucariotas, especialmente hongos.

Esta estrategia analiza todo el genoma presente en una mezcla de microorganismos

• Permite analizar todos los microorganismos presentes en una muestra, así como conocer su proporción
• Aplicaciones, como por ejemplo, identificar diferentes cepas dentro de una misma especie, identificar microorganismos nuevos o identificar microorganismos imposibles o difíciles de cultivar

Conocer la secuencia íntegra del genoma vírico es una herramienta importante en la investigación sobre virus. En ocasiones, el material genético de los virus no puede purificarse o extraerse respecto del huésped. Esto hace que se deban aplicar diferentes estrategias para la secuenciación del material genético vírico.

• Las aplicaciones de este servicio van desde identificar la presencia de determinados virus, identificar cepas y variantes, identificar nuevos virus o el estudio de virus no cultivables.